PRESENTACIÓN
Con el proyecto del genoma humano completado y más de 1000 organismos totalmente secuenciados, la bioinformática está inundándonos con información y en consecuencia esta radicalmente alterando el paradigma de investigación en biología. Es por ello, que actualmente muchas Universidades prestigiosas a nivel mundial están incluyendo el curso de Bioinformática dentro de las carreras de ciencias de la Salud, en Ingeniería e informática.
OBJETIVO: Dar a conocer a la bioinformática como una herramienta potencial en el desarrollo de las ciencias biológicas.
Entrenar a los estudiantes en el uso de las herramientas básicas de la bioinformática.
DIRIGIDO A: Profesionales y estudiantes de áreas de la biología, medicina, farmacia y de otras áreas de la salud, así como de ingeniería e informática.
PROGRAMA TEÓRICO: Para cada clase teórica se empleará dos horas.
Miércoles 25/03/2009, 3:00 pm – 5:00 pm
Importancia de la Bioinformática. Cambio del Paradigma de la Investigación, ejemplos de usos de bases de datos en bioinformática.
Miércoles 25/03/2009, 5:00 pm – 7:00 pm
Asignación de función, Identificación de genes en microorganismos: marcos abiertos de lectura (ORF), promotor, sitios de regulación, bases de datos de RNA, predicciones de estructura secundaria del RNA.
Con el proyecto del genoma humano completado y más de 1000 organismos totalmente secuenciados, la bioinformática está inundándonos con información y en consecuencia esta radicalmente alterando el paradigma de investigación en biología. Es por ello, que actualmente muchas Universidades prestigiosas a nivel mundial están incluyendo el curso de Bioinformática dentro de las carreras de ciencias de la Salud, en Ingeniería e informática.
OBJETIVO: Dar a conocer a la bioinformática como una herramienta potencial en el desarrollo de las ciencias biológicas.
Entrenar a los estudiantes en el uso de las herramientas básicas de la bioinformática.
DIRIGIDO A: Profesionales y estudiantes de áreas de la biología, medicina, farmacia y de otras áreas de la salud, así como de ingeniería e informática.
PROGRAMA TEÓRICO: Para cada clase teórica se empleará dos horas.
Miércoles 25/03/2009, 3:00 pm – 5:00 pm
Importancia de la Bioinformática. Cambio del Paradigma de la Investigación, ejemplos de usos de bases de datos en bioinformática.
Miércoles 25/03/2009, 5:00 pm – 7:00 pm
Asignación de función, Identificación de genes en microorganismos: marcos abiertos de lectura (ORF), promotor, sitios de regulación, bases de datos de RNA, predicciones de estructura secundaria del RNA.
Jueves 26/03/2009, 3:00 pm – 5:00 pm
Análisis de secuencias. Uso de Blast, cambio de parámetros predefinidos, BlastN, BlastX, TBlastN, Phi Blast and PsiBlast. Alineamientos de dos secuencias y alineamiento múltiple, Blast con dos secuencias, construcción de un archivo Múltiple. ClustalW, Multalin, Bloques.
Jueves 26/03/2009, 5:00 pm – 7:00 pm
Análisis de genomas. Análisis de Proteínas y sus Motivos. Reconstrucción metabólica: Kegg y Ergo. Aplicaciones Biotecnológicas de la bioinformática. Genomas bioplásticos y biocombustibles.
PROGRAMA PRÁCTICO:
Viernes 27/03/2009, 3:00 pm – 5:00 pm
Uso de base de datos en Bioinformática: NCBI, Blast. Análisis de secuencias de ADN, Proteínas y RNA. Descarga de programas para visualizar secuencias de ADN y proteínas: Artemis v10, Act, vector. Descarga de base de datos: Blast, genomas, archivos gbk, ftp.
Viernes 27/03/2009, 5:00 pm - 7:00 pm
Caracterización génica de una secuencia de DNA bacteriano. Determinación de ORF, identificación de genes, asignación de función, análisis de promotor y sitios de término de la transcripción, búsqueda de sitios de regulación. Mapeo del contexto génico.
Sábado 28/03/2009, 3:00 pm - 5:00 pm
Genómica comparativa y contexto génico. Uso de herramientas Microbesonline y Softberry. Búsqueda del contexto génico. Implicancias evolutivas. Proyecciones. Revisión y análisis de articulo científico: Anotación del genoma de la bacteria de biominería Acidithiobacillus ferrooxidans.
Seminario Bibliográfico: Discusión de paper. BMC Genomics. 2008. 11:597.
Sábado 28/03/2009, 5:00 pm - 7:00 pm : Diseño de protocolo de Investigación en Bioinformática. Anotación de genes en Genebank. Requerimientos y estrategias. Búsqueda de aplicaciones y servicios en bioinformática. El caso del CBGB en Chile.
LUGAR:
Teoría: Auditorio de Productos Roche Q.F.S.A. Av. Javier Prado Este 1921 – San Borja
Prácticas de Bioinformática: Laboratorio de Informática (4to. Piso) de la Sección de Epidemiología del Instituto de Medicina Tropical “Daniel A. Carrión”. Av. Venezuela s/n. Ciudad Universitaria.
HORARIO: TEORÍA: Miércoles 25 al Jueves 26 de Marzo, de: 3:00 pm - 7:00 pm.
PRÁCTICAS: Viernes 27 al Sábado 28 de Marzo de 3:00 pm a 7:00 pm
INVERSION: Estudiantes: Profesionales:
Teoría : S/. 35 Teoría : S/. 50
Teórico-Práctico : S/. 120 Teórico- Práctico : S/. 215
IGV incluido. Hacer los depósitos en el Nro. de Cuenta: 193-1315244092 del Banco de Crédito a nombre de la Fundación San Marcos. El Curso Práctico tendrá VACANTES LIMITADAS.
INSCRIPCIONES:
Fundación San Marcos – Av. Venezuela s/n Pabellón Biblioteca Central- UNMSM- Oficina 210-211 – Ciudad Universitaria, Lima 1. Telf.: 452-6053 / 6197000 – Anexo 7655.
Laboratorio de Química Bioorgánica (Sótano) del Centro de Investigación de Bioquímica y Nutrición- Facultad de Medicina Humana – UNMSM - Av. Grau 755 – Lima 1.
Se hará entrega de un Fólder de trabajo, CD y material de curso.
INFORMES. E-mail: neurobio_peru@yahoo.com - Telf.: 990546094 - 990131423
Análisis de secuencias. Uso de Blast, cambio de parámetros predefinidos, BlastN, BlastX, TBlastN, Phi Blast and PsiBlast. Alineamientos de dos secuencias y alineamiento múltiple, Blast con dos secuencias, construcción de un archivo Múltiple. ClustalW, Multalin, Bloques.
Jueves 26/03/2009, 5:00 pm – 7:00 pm
Análisis de genomas. Análisis de Proteínas y sus Motivos. Reconstrucción metabólica: Kegg y Ergo. Aplicaciones Biotecnológicas de la bioinformática. Genomas bioplásticos y biocombustibles.
PROGRAMA PRÁCTICO:
Viernes 27/03/2009, 3:00 pm – 5:00 pm
Uso de base de datos en Bioinformática: NCBI, Blast. Análisis de secuencias de ADN, Proteínas y RNA. Descarga de programas para visualizar secuencias de ADN y proteínas: Artemis v10, Act, vector. Descarga de base de datos: Blast, genomas, archivos gbk, ftp.
Viernes 27/03/2009, 5:00 pm - 7:00 pm
Caracterización génica de una secuencia de DNA bacteriano. Determinación de ORF, identificación de genes, asignación de función, análisis de promotor y sitios de término de la transcripción, búsqueda de sitios de regulación. Mapeo del contexto génico.
Sábado 28/03/2009, 3:00 pm - 5:00 pm
Genómica comparativa y contexto génico. Uso de herramientas Microbesonline y Softberry. Búsqueda del contexto génico. Implicancias evolutivas. Proyecciones. Revisión y análisis de articulo científico: Anotación del genoma de la bacteria de biominería Acidithiobacillus ferrooxidans.
Seminario Bibliográfico: Discusión de paper. BMC Genomics. 2008. 11:597.
Sábado 28/03/2009, 5:00 pm - 7:00 pm : Diseño de protocolo de Investigación en Bioinformática. Anotación de genes en Genebank. Requerimientos y estrategias. Búsqueda de aplicaciones y servicios en bioinformática. El caso del CBGB en Chile.
LUGAR:
Teoría: Auditorio de Productos Roche Q.F.S.A. Av. Javier Prado Este 1921 – San Borja
Prácticas de Bioinformática: Laboratorio de Informática (4to. Piso) de la Sección de Epidemiología del Instituto de Medicina Tropical “Daniel A. Carrión”. Av. Venezuela s/n. Ciudad Universitaria.
HORARIO: TEORÍA: Miércoles 25 al Jueves 26 de Marzo, de: 3:00 pm - 7:00 pm.
PRÁCTICAS: Viernes 27 al Sábado 28 de Marzo de 3:00 pm a 7:00 pm
INVERSION: Estudiantes: Profesionales:
Teoría : S/. 35 Teoría : S/. 50
Teórico-Práctico : S/. 120 Teórico- Práctico : S/. 215
IGV incluido. Hacer los depósitos en el Nro. de Cuenta: 193-1315244092 del Banco de Crédito a nombre de la Fundación San Marcos. El Curso Práctico tendrá VACANTES LIMITADAS.
INSCRIPCIONES:
Fundación San Marcos – Av. Venezuela s/n Pabellón Biblioteca Central- UNMSM- Oficina 210-211 – Ciudad Universitaria, Lima 1. Telf.: 452-6053 / 6197000 – Anexo 7655.
Laboratorio de Química Bioorgánica (Sótano) del Centro de Investigación de Bioquímica y Nutrición- Facultad de Medicina Humana – UNMSM - Av. Grau 755 – Lima 1.
Se hará entrega de un Fólder de trabajo, CD y material de curso.
INFORMES. E-mail: neurobio_peru@yahoo.com - Telf.: 990546094 - 990131423
